汽车水箱的作用是用来散热的，因为一些用水等原因常常会造成水箱出现水垢，如果不及时的清除，那么就对散热造成影响，所以要及时的清理。
水垢的导热系数很低，仅是铸铁的1/25，黄铜的1/50，形成于缸体衬里及缸盖水道的水垢，使局部区域因散热性变差而温度上升，会导致发动机薄弱部位产生裂纹及缸盖变形。它还不仅仅使冷却系统散热性能变差，出现局部高温区，恶化润滑条件，使发动机温度升高，加速发动机系统的磨损；还堵塞散热管或冷却系统管路等，大大降低传热效率，使发动机过热直接危害驾驶人员的安全。
水垢清洗剂
需拆卸水箱，清除不彻底、异味大、腐蚀性强，易造成水箱老化，缩短其使用寿命。
人工清理
需把汽车水箱拆卸下来，用刮、铲等清除水垢，这样虽然可以除垢，但是效率低、劳动强度大，不易清除干净，而且也容易造成水箱二次损害。
专业汽车水箱除垢剂
直接将专用的水垢清洗剂倒入汽车水循环系统中，让其浸泡、怠速循环或行驶20-30分钟后，将水箱及系统内部的除垢剂排放掉，加水反复冲洗干净既可有效清除发动机水循环系统中的水垢、锈、泥及各种有害物质。
虽然清理水垢是有办法，但是车主在平时还是要注意减少水垢的产生，要注意使用防冻液，尤其是现在夏季就要到了，千万别用普通的水来代替防冻液，因为防冻液除了防冻外，还能减少水箱开锅的现象发生，如用普通水，不能避免开锅不说，水里面的矿物质还会加速水垢的形成。